Plan B가 있는 인생~!^^

안녕하세요~! 샤봉입니다. 오늘부터 제가 사용해본 Bioinformatics Tools을 지속적으로 업데이트 하려고 합니다. 설치 항목은 제가 설치해본곳만 기입합니다~!^^ 다른 OS는 링크를 통해 확인부탁드립니다~!^^ No. Tool Name 용도 Input Output 설치 링크 비고 1 FastQC Fastq 품질 확인 Fastq File 보고서.html Win/Linux site 단일 샘플만 가능 2 MultiQC Fastq 품질 확인 Fastq File 통계 Log file 보고서.html Linux site 다수의 샘플 가능 직관적인 비교가능 통계 수치 비교 가능 3 BWA-MEM Reference 서열에 DNA 서열 Mapping Ref.fa File Fastq File SAM File L..

안녕하세요~!! 샤봉입니다~!!^^ NGS 과정 중 검사가 끝난 뒤, 생성된 염기서열 Data를 분석하는 과정을 Dry Bench(인증기관 용어)라고 해요. Bioinformatics / Data Analysis 등등...표현하기 나름인것 같아요~!!^^ 저는 임상병리사이지만, NGS Data 분석을 알기위해서 노력하고 있습니다.^^ NGS를 처음 알때보다는 지금이 더 많이 아는 것 같지만.... 아직도... 부족하네요!!^^아주 많이 몰라요....ㅎㅎ NGS 데이터 분석의 첫걸음은 무엇일까요~? 검사 후 NGS 장비에서 나온 따끈따끈한 Raw Data를 살펴봐야겠죠? 그 Data를 Fastq File 이라고 불러요~! Fastq File은 NGS 장비에서 만들어준~~ Sequence에 quality 점..