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NGS_Dry bench

[샤봉's Pick]_Bioinformatics Tools

샤봉 2022. 5. 18. 22:20
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출처 : https://www.mayo.edu/research/core-resources/bioinformatics-core/overview

안녕하세요~! 샤봉입니다.

오늘부터 제가 사용해본 Bioinformatics Tools을 지속적으로 업데이트 하려고 합니다.

설치 항목은 제가 설치해본곳만 기입합니다~!^^ 다른 OS는 링크를 통해 확인부탁드립니다~!^^

No. Tool Name 용도 Input Output 설치 링크 비고
1 FastQC Fastq 품질 확인 Fastq File 보고서.html Win/Linux site 단일 샘플만 가능
2 MultiQC Fastq 품질 확인 Fastq File
통계 Log file
보고서.html Linux site 다수의 샘플 가능
직관적인 비교가능
통계 수치 비교 가능
3 BWA-MEM Reference 서열에
DNA 서열 Mapping
Ref.fa File
Fastq File
SAM File Linux site  
               
               
               
               

Bioinformatics Tools의 업데이트는 천천히 지속적으로 업데이트 하도록 하겠습니다.

저는 해당 분야에 비전문가로서 저와 같이 비전문가로서 공부하시는 분들께 조금이나 도움이 되기를 바라며 올립니다.

감사합니다^^

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